อัตราค่าบริการ เป็นไปตามปริมาณงาน โดยมีแนวทางในการคำนวณปริมาณงาน ดังนี้

1. ค่าตอบแทนที่­ให้แก่ที่ปรึกษา หรือผู้ร่วมโครงการ (เฉพาะบุคคลภายนอก) โดยอิงกับคุณวุฒิ ประสบการณ์ ลักษณะงาน บทบาทและภาระงาน โดยวิธีคิดดังนี้

วิธีที่ 1 กรณีค่าตอบแทนที่ปรึกษาโครงการที่มาให้คำปรึกษาเป็นรายครั้ง คิดอัตราเป็นต่อครั้ง โดยอ้างอิงอัตราตาม ระเบียบคณะกรรมการบริหารสถาบันวิจัยแสงซินโครตรอน
ว่าด้วยการเงิน การบัญชี และการงบประมาณ พ.ศ. 2552 ฉบับแก้ไขเพิ่มเติม พ.ศ. 2554 เอกสารแนบท้ายหมายเลข 4(1) ค่าสมนาคุณวิทยากร

วิธีที่ 2  กรณีผู้ร่วมโครงการ (เฉพาะบุคคลภายนอก) คิดอัตราค่าตอบแทนเป็นรายโครงการ

 โดยมีแนวทางวิธีการคำนวณอัตราค่าตอบแทน คิดตามสูตรทั้งนี้

อัตราค่าตอบแทน    =  A x B x C x D

A   =   อัตราค่าแรงอ้างอิงจากอัตราค่าแรงเจ้าหน้าที่ (ตามบัญชีแนบท้าย 10)

B   =   จำนวนชั่วโมงที่ใช้ในโครงการต่อเดือน

C   =   จำนวนเดือนของโครงการ

D   =   ตัวคูณซึ่งมีค่าอยู่ในช่วง 1 - 3 โดยพิจารณาตามคุณวุฒิ และประสบการณ์

2. ค่าแรงเจ้าหน้าที่สถาบัน เป็นไปตามอัตราค่าแรงเจ้าหน้าที่ (ตามบัญชีแนบท้าย 10)

3. ค่าใช้สอย หมายถึง

- ค่าใช้จ่ายในการดำเนินงานโครงการ เช่น ค่าเดินทาง ค่าที่พัก ค่าวิเคราะห์ทดสอบตัวอย่าง เป็นต้น

- ค่าจ้างเหมา ค่าจ้างทำอุปกรณ์ เป็นต้น

- ค่าจ้างเพื่อทำงานในส่วนที่โครงการไม่ควรเสียเวลาทำเอง เช่น ค่าจ้างผู้ช่วยวิจัย ค่าจ้างเตรียมตัวอย่าง ค่าจ้างนักศึกษาเก็บข้อมูลหรือออกภาคสนาม คิดในอัตราชั่วโมงละ 50 บาท หรืออัตราเหมาจ่ายเป็นรายชิ้นงาน

4. ค่าวัสดุ หมายถึง ค่าใช้จ่ายจัดซื้อวัสดุสิ้นเปลือง เช่น สารเคมี กระดาษ หมึกพิมพ์ วัตถุดิบทดลอง เป็นต้น

5. ค่าธรรมเนียมการให้บริการ 25 % จากต้นทุนรวมทั้งหมด